| Name | What | Region | Country | Lat | Long | Elev Ft. | Pop Est |
| Yahata | city | Niigata-ken | Japan | 37.9833333 | 138.3333333 | 0 | 14303 |
| Yahiko | city | Niigata-ken | Japan | 37.7 | 138.8333333 | 98 | 17280 |
| Yama-igarashi | city | Niigata-ken | Japan | 37.85 | 138.9333333 | 3 | 15024 |
| Yama-ikarashi | city | Niigata-ken | Japan | 37.85 | 138.9333333 | 3 | 15024 |
| Yamakumada | city | Niigata-ken | Japan | 38.45 | 139.6666667 | 761 | 21610 |
| Yamakumata | city | Niigata-ken | Japan | 38.45 | 139.6666667 | 761 | 21610 |
| Yamanoshita | city | Niigata-ken | Japan | 37.9333333 | 139.0666667 | 3 | 12173 |
| Yamauchi | city | Niigata-ken | Japan | 37.8666667 | 139.4 | 383 | 23315 |
| Yamauji | city | Niigata-ken | Japan | 37.8666667 | 139.4 | 383 | 23315 |
| Yanagyudo | city | Niigata-ken | Japan | 38.2 | 139.6333333 | 1082 | 22756 |
| Yanagyuto | city | Niigata-ken | Japan | 38.2 | 139.6333333 | 1082 | 22756 |
| Yanagyūdo | city | Niigata-ken | Japan | 38.2 | 139.6333333 | 1082 | 22756 |
| Yanagyūtō | city | Niigata-ken | Japan | 38.2 | 139.6333333 | 1082 | 22756 |
| Yasuda | city | Niigata-ken | Japan | 37.7666667 | 139.2333333 | 75 | 23339 |
| Yasuta | city | Niigata-ken | Japan | 37.7666667 | 139.2333333 | 75 | 23339 |
| Yasutsuka | city | Niigata-ken | Japan | 37.1333333 | 138.4666667 | 561 | 23535 |
| Yasuzuka | city | Niigata-ken | Japan | 37.1333333 | 138.4666667 | 561 | 23535 |
| Yawata | city | Niigata-ken | Japan | 37.9833333 | 138.3333333 | 0 | 14303 |
| Yoita | city | Niigata-ken | Japan | 37.5333333 | 138.8166667 | 49 | 23422 |
| Yokkamachi | city | Niigata-ken | Japan | 37.9666667 | 138.35 | 173 | 18755 |
| Yokogoshi | city | Niigata-ken | Japan | 37.85 | 139.15 | 3 | 23315 |
| Yokoyama | city | Niigata-ken | Japan | 38.0666667 | 138.3833333 | 282 | 21369 |
| Yonekura | city | Niigata-ken | Japan | 37.9 | 139.3833333 | 154 | 23301 |
| Yonozu | city | Niigata-ken | Japan | 37.7 | 138.9 | 16 | 23366 |
| Yonōzu | city | Niigata-ken | Japan | 37.7 | 138.9 | 16 | 23366 |
| Yoshida | city | Niigata-ken | Japan | 37.6833333 | 138.8833333 | 16 | 23366 |
| Yoshii | city | Niigata-ken | Japan | 38.05 | 138.4 | 164 | 21369 |
| Yotsugoya | city | Niigata-ken | Japan | 37.85 | 138.8833333 | 0 | 10364 |
| Yotsugōya | city | Niigata-ken | Japan | 37.85 | 138.8833333 | 0 | 10364 |
| Yotsukamachi | city | Niigata-ken | Japan | 37.9666667 | 138.35 | 173 | 18755 |
| Yotsuya | city | Niigata-ken | Japan | 37.2333333 | 138.3333333 | 85 | 10242 |
| Yotsuyahama | city | Niigata-ken | Japan | 37.2333333 | 138.3333333 | 85 | 10242 |
| Yukawachi | city | Niigata-ken | Japan | 36.9833333 | 138.0166667 | 1751 | 23590 |
| Yunokami | city | Niigata-ken | Japan | 37.8166667 | 138.2166667 | 180 | 5221 |
| Yunokawachi | city | Niigata-ken | Japan | 36.9833333 | 138.0166667 | 1751 | 23590 |
| Yunokochi | city | Niigata-ken | Japan | 36.9833333 | 138.0166667 | 1751 | 23590 |
| Yunokoti | city | Niigata-ken | Japan | 36.9833333 | 138.0166667 | 1751 | 23590 |
| Yunokōchi | city | Niigata-ken | Japan | 36.9833333 | 138.0166667 | 1751 | 23590 |
| Yusawa | city | Niigata-ken | Japan | 36.9333333 | 138.8166667 | 1256 | 23601 |
| Yuzawa | city | Niigata-ken | Japan | 36.9333333 | 138.8166667 | 1256 | 23601 |
|
|