| Name | What | Region | Country | Lat | Long | Elev Ft. | Pop Est |
| Sadoyama | city | Niigata-ken | Japan | 37.7166667 | 138.9166667 | 9 | 23352 |
| Sakamachi | city | Niigata-ken | Japan | 38.1166667 | 139.45 | 134 | 21788 |
| Sakaya | city | Niigata-ken | Japan | 37.8333333 | 139.0666667 | 6 | 23328 |
| Sambongi | city | Niigata-ken | Japan | 37.75 | 139.1833333 | 49 | 23352 |
| Sampoku | city | Niigata-ken | Japan | 38.4883333 | 139.55 | 656 | 20675 |
| Samponki | city | Niigata-ken | Japan | 37.75 | 139.1833333 | 49 | 23352 |
| Samukawa | city | Niigata-ken | Japan | 38.45 | 139.4833333 | 0 | 10310 |
| Sandscho | city | Niigata-ken | Japan | 37.6166667 | 138.95 | 59 | 23394 |
| Sandyo | city | Niigata-ken | Japan | 37.6166667 | 138.95 | 59 | 23394 |
| Sanegawa | city | Niigata-ken | Japan | 37.7333333 | 139.6166667 | 1968 | 22631 |
| Sanekawa | city | Niigata-ken | Japan | 37.7333333 | 139.6166667 | 1968 | 22631 |
| Sanjo | city | Niigata-ken | Japan | 37.6166667 | 138.95 | 59 | 23394 |
| Sanjō | city | Niigata-ken | Japan | 37.6166667 | 138.95 | 59 | 23394 |
| Sanzyo | city | Niigata-ken | Japan | 37.6166667 | 138.95 | 59 | 23394 |
| Sanzyō | city | Niigata-ken | Japan | 37.6166667 | 138.95 | 59 | 23394 |
| Sarusawa | city | Niigata-ken | Japan | 38.2833333 | 139.5166667 | 164 | 23184 |
| Sasagawa | city | Niigata-ken | Japan | 38.3833333 | 139.45 | 0 | 5346 |
| Sasaguchihama | city | Niigata-ken | Japan | 38.0833333 | 139.3666667 | 82 | 15545 |
| Sawada | city | Niigata-ken | Japan | 37.55 | 138.7166667 | 131 | 13996 |
| Sawane | city | Niigata-ken | Japan | 37.9833333 | 138.2666667 | 0 | 8967 |
| Sawane | city | Niigata-ken | Japan | 38 | 138.2666667 | 3 | 8967 |
| Sawane Sawanemachi | city | Niigata-ken | Japan | 38 | 138.2666667 | 3 | 8967 |
| Sawanemachi | city | Niigata-ken | Japan | 38 | 138.2666667 | 3 | 8967 |
| Sawasaki | city | Niigata-ken | Japan | 37.8166667 | 138.2166667 | 180 | 5221 |
| Sawazaki | city | Niigata-ken | Japan | 37.8166667 | 138.2166667 | 180 | 5221 |
| Seiro | city | Niigata-ken | Japan | 37.9833333 | 139.255 | 29 | 19243 |
| Seirō | city | Niigata-ken | Japan | 37.9833333 | 139.255 | 29 | 19243 |
| Seki | city | Niigata-ken | Japan | 36.9 | 138.1666667 | 2808 | 23108 |
| Seki | city | Niigata-ken | Japan | 36.9833333 | 138.8 | 905 | 23590 |
| Sekiguchi | city | Niigata-ken | Japan | 38.3 | 139.55 | 223 | 23170 |
| Sekihara | city | Niigata-ken | Japan | 37.45 | 138.7833333 | 223 | 23444 |
| Sekionsen | city | Niigata-ken | Japan | 36.9 | 138.1666667 | 2808 | 23108 |
| Sekiya | city | Niigata-ken | Japan | 37.9 | 139.0166667 | 3 | 16041 |
| Sekiya-machi | city | Niigata-ken | Japan | 37.9 | 139.0166667 | 3 | 16041 |
| Sekiyama | city | Niigata-ken | Japan | 36.9333333 | 138.2166667 | 1276 | 23601 |
| Senami | city | Niigata-ken | Japan | 38.2166667 | 139.45 | 164 | 10538 |
| Senami | city | Niigata-ken | Japan | 38.2333333 | 139.45 | 55 | 10538 |
| Senju | city | Niigata-ken | Japan | 37.15 | 138.7333333 | 488 | 23535 |
| Senjyu | city | Niigata-ken | Japan | 37.15 | 138.7333333 | 488 | 23535 |
| Shibata | city | Niigata-ken | Japan | 37.95 | 139.3333333 | 131 | 23287 |
| Shichiku | city | Niigata-ken | Japan | 37.9 | 139.0833333 | 3 | 20232 |
| Shigoya | city | Niigata-ken | Japan | 37.85 | 138.8833333 | 0 | 10364 |
| Shigōya | city | Niigata-ken | Japan | 37.85 | 138.8833333 | 0 | 10364 |
| Shiiya | city | Niigata-ken | Japan | 37.4666667 | 138.6166667 | 295 | 6833 |
| Shimamibama | city | Niigata-ken | Japan | 37.9666667 | 139.2 | 29 | 12023 |
| Shimamihama | city | Niigata-ken | Japan | 37.9666667 | 139.2 | 29 | 12023 |
| Shimasaki | city | Niigata-ken | Japan | 37.5833333 | 138.7666667 | 75 | 20523 |
| Shimazaki | city | Niigata-ken | Japan | 37.5833333 | 138.7666667 | 75 | 20523 |
| Shimbo | city | Niigata-ken | Japan | 38.0166667 | 138.3833333 | 95 | 22414 |
| Shimbō | city | Niigata-ken | Japan | 38.0166667 | 138.3833333 | 95 | 22414 |
| Shimizu | city | Niigata-ken | Japan | 37.7 | 138.9833333 | 13 | 23366 |
| Shimmachi | city | Niigata-ken | Japan | 37.9666667 | 138.35 | 173 | 18755 |
| Shimo-igarashi | city | Niigata-ken | Japan | 37.8666667 | 138.95 | 3 | 15024 |
| Shimo-ikarashi | city | Niigata-ken | Japan | 37.8666667 | 138.95 | 3 | 15024 |
| Shimo-inazuka | city | Niigata-ken | Japan | 37.0833333 | 138.3166667 | 190 | 23562 |
| Shimo-okawamaedori | city | Niigata-ken | Japan | 37.9166667 | 139.05 | 3 | 12173 |
| Shimo-seki | city | Niigata-ken | Japan | 38.0833333 | 139.5666667 | 347 | 23245 |
| Shimo-shimbo | city | Niigata-ken | Japan | 38.25 | 139.5333333 | 164 | 23198 |
| Shimo-shinbo | city | Niigata-ken | Japan | 38.25 | 139.5333333 | 164 | 23198 |
| Shimo-takayanagi | city | Niigata-ken | Japan | 37.6 | 139.1166667 | 324 | 23394 |
| Shimo-tokorojima | city | Niigata-ken | Japan | 37.9 | 139.05 | 3 | 20232 |
| Shimo-tokoroshima | city | Niigata-ken | Japan | 37.9 | 139.05 | 3 | 20232 |
| Shimo-tsuboana | city | Niigata-ken | Japan | 38.05 | 139.4666667 | 328 | 23245 |
| Shimo-yokoyama | city | Niigata-ken | Japan | 38.05 | 138.4 | 164 | 21369 |
| Shimo-zuboana | city | Niigata-ken | Japan | 38.05 | 139.4666667 | 328 | 23245 |
| Shimo-ōkawamaedōri | city | Niigata-ken | Japan | 37.9166667 | 139.05 | 3 | 12173 |
| Shimojo | city | Niigata-ken | Japan | 37.65 | 139.0333333 | 239 | 23380 |
| Shinbo | city | Niigata-ken | Japan | 38.0166667 | 138.3833333 | 95 | 22414 |
| Shindo | city | Niigata-ken | Japan | 37.3166667 | 138.5666667 | 137 | 22586 |
| Shindō | city | Niigata-ken | Japan | 37.3166667 | 138.5666667 | 137 | 22586 |
| Shionomachi | city | Niigata-ken | Japan | 38.3166667 | 139.55 | 223 | 23170 |
| Shioya | city | Niigata-ken | Japan | 38.15 | 139.4166667 | 16 | 17843 |
| Shiozawa | city | Niigata-ken | Japan | 37.0333333 | 138.85 | 606 | 23576 |
| Shirone | city | Niigata-ken | Japan | 37.7666667 | 139.0166667 | 16 | 23339 |
| Shirose-shinden | city | Niigata-ken | Japan | 38.1333333 | 138.45 | 0 | 16271 |
| Shiunji | city | Niigata-ken | Japan | 38.0166667 | 139.35 | 118 | 21385 |
| Shose | city | Niigata-ken | Japan | 37.7166667 | 139.0333333 | 9 | 23352 |
| Shoze | city | Niigata-ken | Japan | 37.7166667 | 139.0333333 | 9 | 23352 |
| Shōse | city | Niigata-ken | Japan | 37.7166667 | 139.0333333 | 9 | 23352 |
| Shōze | city | Niigata-ken | Japan | 37.7166667 | 139.0333333 | 9 | 23352 |
| Somi | city | Niigata-ken | Japan | 37.8333333 | 139.15 | 6 | 23328 |
| Sone | city | Niigata-ken | Japan | 37.8 | 138.9166667 | 3 | 21900 |
| Soumi | city | Niigata-ken | Japan | 37.8333333 | 139.15 | 6 | 23328 |
| Sugawa | city | Niigata-ken | Japan | 37.05 | 138.4833333 | 2017 | 23109 |
| Suginosawa | city | Niigata-ken | Japan | 36.85 | 138.1666667 | 2250 | 21624 |
| Suibara | city | Niigata-ken | Japan | 37.8333333 | 139.2333333 | 32 | 23328 |
| Suitsu | city | Niigata-ken | Japan | 38.0666667 | 138.5666667 | 3 | 8149 |
| Suizu | city | Niigata-ken | Japan | 38.0666667 | 138.5666667 | 3 | 8149 |
| Sōmi | city | Niigata-ken | Japan | 37.8333333 | 139.15 | 6 | 23328 |
|
|