| Name | What | Region | Country | Lat | Long | Elev Ft. | Pop Est |
| Saji | city | Hyogo-ken | Japan | 35.2333333 | 135 | 731 | 77688 |
| Sakai | city | Hyogo-ken | Japan | 34.45 | 134.7833333 | 0 | 22721 |
| Sakoshi | city | Hyogo-ken | Japan | 34.7666667 | 134.4333333 | 3 | 52954 |
| Sakosi | city | Hyogo-ken | Japan | 34.7666667 | 134.4333333 | 3 | 52954 |
| Sanda | city | Hyogo-ken | Japan | 34.8833333 | 135.2333333 | 528 | 79506 |
| Sano | city | Hyogo-ken | Japan | 34.4666667 | 134.9333333 | 55 | 50242 |
| Sasayama | city | Hyogo-ken | Japan | 35.0666667 | 135.2166667 | 748 | 79343 |
| Sayo | city | Hyogo-ken | Japan | 35 | 134.3666667 | 656 | 79249 |
| Sayō | city | Hyogo-ken | Japan | 35 | 134.3666667 | 656 | 79249 |
| Sekinomiya | city | Hyogo-ken | Japan | 35.3666667 | 134.6333333 | 1568 | 79059 |
| Sembon | city | Hyogo-ken | Japan | 34.9333333 | 134.4833333 | 984 | 79465 |
| Senzo | city | Hyogo-ken | Japan | 34.7833333 | 135.4 | 32 | 121638 |
| Senzō | city | Hyogo-ken | Japan | 34.7833333 | 135.4 | 32 | 121638 |
| Shico | city | Hyogo-ken | Japan | 34.4166667 | 134.9 | 0 | 56700 |
| Shigeyuki | city | Hyogo-ken | Japan | 35.1166667 | 134.75 | 1640 | 79304 |
| Shikama | city | Hyogo-ken | Japan | 34.8 | 134.6666667 | 22 | 64404 |
| Shikamacho | city | Hyogo-ken | Japan | 34.8 | 134.6666667 | 22 | 64404 |
| Shikamachō | city | Hyogo-ken | Japan | 34.8 | 134.6666667 | 22 | 64404 |
| Shikata | city | Hyogo-ken | Japan | 34.8166667 | 134.8166667 | 173 | 78596 |
| Shimagamicho | city | Hyogo-ken | Japan | 34.6666667 | 135.1833333 | 3 | 53500 |
| Shimagamichō | city | Hyogo-ken | Japan | 34.6666667 | 135.1833333 | 3 | 53500 |
| Shimakamicho | city | Hyogo-ken | Japan | 34.6666667 | 135.1833333 | 3 | 53500 |
| Shimakamichō | city | Hyogo-ken | Japan | 34.6666667 | 135.1833333 | 3 | 53500 |
| Shimayacho | city | Hyogo-ken | Japan | 34.6666667 | 135.4333333 | 0 | 212926 |
| Shimayachō | city | Hyogo-ken | Japan | 34.6666667 | 135.4333333 | 0 | 212926 |
| Shimo-takino | city | Hyogo-ken | Japan | 34.9333333 | 134.9666667 | 246 | 79465 |
| Shimo-tanigami | city | Hyogo-ken | Japan | 34.7666667 | 135.1666667 | 905 | 79626 |
| Shimo-yamatedori | city | Hyogo-ken | Japan | 34.6833333 | 135.1833333 | 3 | 53500 |
| Shimo-yamatedōri | city | Hyogo-ken | Japan | 34.6833333 | 135.1833333 | 3 | 53500 |
| Shimo-yaue | city | Hyogo-ken | Japan | 34.7666667 | 135.1666667 | 905 | 79626 |
| Shimonada | city | Hyogo-ken | Japan | 34.2 | 134.8 | 0 | 28054 |
| Shingu | city | Hyogo-ken | Japan | 34.9166667 | 134.55 | 252 | 79465 |
| Shingū | city | Hyogo-ken | Japan | 34.9166667 | 134.55 | 252 | 79465 |
| Shinkaichi | city | Hyogo-ken | Japan | 34.6666667 | 135.1666667 | 26 | 53500 |
| Shinzaike | city | Hyogo-ken | Japan | 34.7833333 | 134.6 | 3 | 36871 |
| Shio | city | Hyogo-ken | Japan | 34.4166667 | 134.9 | 0 | 56700 |
| Shioo | city | Hyogo-ken | Japan | 34.4166667 | 134.9 | 0 | 56700 |
| Shioya | city | Hyogo-ken | Japan | 34.7666667 | 134.3833333 | 262 | 60069 |
| Shirahama | city | Hyogo-ken | Japan | 34.7833333 | 134.7166667 | 32 | 40757 |
| Shirahama-ku | city | Hyogo-ken | Japan | 34.7833333 | 134.7166667 | 32 | 40757 |
| Shirasaki | city | Hyogo-ken | Japan | 34.2333333 | 134.85 | 3 | 44221 |
| Shirosaki | city | Hyogo-ken | Japan | 34.2333333 | 134.85 | 3 | 44221 |
| Shitsuki | city | Hyogo-ken | Japan | 34.4333333 | 134.9 | 3 | 56700 |
| Shizuki | city | Hyogo-ken | Japan | 34.4333333 | 134.9 | 3 | 56700 |
| Shojo | city | Hyogo-ken | Japan | 34.8166667 | 134.5333333 | 223 | 68557 |
| Shōjō | city | Hyogo-ken | Japan | 34.8166667 | 134.5333333 | 223 | 68557 |
| Sizuki | city | Hyogo-ken | Japan | 34.4333333 | 134.9 | 3 | 56700 |
| Sumiyoshicho | city | Hyogo-ken | Japan | 35.0333333 | 135.05 | 656 | 79385 |
| Sumiyoshichô | city | Hyogo-ken | Japan | 35.0333333 | 135.05 | 656 | 79385 |
| Sumoto | city | Hyogo-ken | Japan | 34.35 | 134.9 | 3 | 52120 |
|
|