| Name | What | Region | Country | Lat | Long | Elev Ft. | Pop Est |
| Ya Umboh | city | | Indonesia | -7.7333333 | 139.9666667 | 6 | 378 |
| Yaba | city | | Indonesia | -0.4333333 | 127.45 | 383 | 609 |
| Yabi | city | | Indonesia | -3.7166667 | 135.2166667 | 2011 | 887 |
| Yabowo | city | | Indonesia | -7.8166667 | 139.0833333 | 3 | 308 |
| Yaburfulu | city | | Indonesia | 2.5833333 | 96.0666667 | 196 | 2766 |
| Yafi | city | Provinsi Papua | Indonesia | -3.3333333 | 140.9166667 | 1381 | 1191 |
| Yafila | city | Propinsi Maluku | Indonesia | -6.9722222 | 129.15 | 0 | 272 |
| Yahtuak | city | | Indonesia | -1.65 | 133.1166667 | 531 | 691 |
| Yakatra | city | | Indonesia | -6.1397222 | 106.8269444 | 6 | 1893983 |
| Yakau | city | | Indonesia | -7.9666667 | 140.6 | 157 | 378 |
| Yakorra | city | | Indonesia | -2.1 | 133.05 | 62 | 691 |
| Yali Ali | city | | Indonesia | -1.7833333 | 134.2166667 | 190 | 155 |
| Yaltubung | city | Propinsi Maluku | Indonesia | -7.8 | 129.7166667 | 246 | 1762 |
| Yaltubung | city | | Indonesia | -7.7833333 | 129.7333333 | 0 | 670 |
| Yaman | city | | Indonesia | -7.1833333 | 139 | 3 | 265 |
| Yamas | city | Provinsi Papua | Indonesia | -2.9666667 | 140.6333333 | 1853 | 1195 |
| Yambe | city | | Indonesia | -1.3 | 132.6333333 | 1095 | 1181 |
| Yamboi | city | | Indonesia | -1.35 | 134.05 | 2076 | 691 |
| Yambuike | city | | Indonesia | -7.4 | 140.1 | 3 | 378 |
| Yambunun | city | | Indonesia | -3.05 | 132.65 | 3313 | 327 |
| Yaminas | city | Propinsi Sulawesi Selatan | Indonesia | -3.2744444 | 120.2708333 | 314 | 6692 |
| Yamluli | city | | Indonesia | -8.25 | 128.2166667 | 3 | 1766 |
| Yamtil | city | Propinsi Maluku | Indonesia | -5.6 | 132.3166667 | 3 | 760 |
| Yamtil | city | | Indonesia | -5.6833333 | 132.9833333 | 285 | 1202 |
| Yamtimur | city | | Indonesia | -5.5833333 | 133.0833333 | 1141 | 2049 |
| Yangkena | city | | Indonesia | -2.5 | 140.3833333 | 413 | 1191 |
| Yango | city | Propinsi Sulawesi Tengah | Indonesia | 1.0436111 | 122.125 | 85 | 2608 |
| Yanim | city | | Indonesia | -0.6833333 | 135.6666667 | 3 | 2210 |
| Yanke | city | | Indonesia | -7.4666667 | 140.5 | 111 | 378 |
| Yansip | city | | Indonesia | -2.6666667 | 140.25 | 751 | 1198 |
| Yansoribo | city | | Indonesia | -0.7333333 | 133.7833333 | 19 | 305 |
| Yaona | city | | Indonesia | -2.4166667 | 140.3833333 | 534 | 766 |
| Yapakopra | city | | Indonesia | -4.4 | 135.0833333 | 0 | 84 |
| Yapara | city | | Indonesia | -6.5833333 | 110.65 | 6 | 29404 |
| Yapas | city | Propinsi Maluku | Indonesia | -5.3583333 | 131.95 | 337 | 478 |
| Yapero | city | Provinsi Papua | Indonesia | -4.9833333 | 137.1833333 | 3 | 134 |
| Yapsi | city | | Indonesia | -2.7833333 | 140.0333333 | 997 | 1195 |
| Yapueng | city | | Indonesia | 5.3666667 | 95.5166667 | 390 | 12769 |
| Yaputih | city | | Indonesia | -3.3333333 | 129.5166667 | 0 | 2222 |
| Yaputih | city | Propinsi Maluku | Indonesia | -3.2933333 | 129.5283333 | 36 | 2222 |
| Yaratuar | city | | Indonesia | -2.9666667 | 134.6666667 | 551 | 693 |
| Yaro | city | | Indonesia | 1.6 | 128.0166667 | 0 | 4487 |
| Yasibak | city | | Indonesia | -7.1666667 | 140.0666667 | 3 | 378 |
| Yatoke | city | | Indonesia | -7.85 | 129.85 | 0 | 955 |
| Yauer-Manokwari | city | | Indonesia | -3.0166667 | 134.8166667 | 324 | 617 |
| Yauke | city | | Indonesia | -1.6166667 | 137.9166667 | 3 | 335 |
| Yaurun | city | | Indonesia | -7.2 | 139.9666667 | 3 | 378 |
| Yaverun | city | | Indonesia | -7.2 | 139.9666667 | 3 | 378 |
| Yawali | city | | Indonesia | -7.7333333 | 139.7333333 | 3 | 378 |
| Yawang | city | | Indonesia | -9.9333333 | 120.6833333 | 226 | 2477 |
| Yawimu | city | | Indonesia | -7.8 | 139.75 | 3 | 378 |
| Ye | city | | Indonesia | -7.4333333 | 140.5 | 98 | 378 |
| Yee | city | | Indonesia | -7.4333333 | 140.5 | 98 | 378 |
| Yeem | city | | Indonesia | -7.7666667 | 140 | 3 | 378 |
| Yef Lio | city | | Indonesia | -1.0666667 | 131.2333333 | 3 | 459 |
| Yehembang | city | | Indonesia | -8.4 | 114.75 | 3 | 22106 |
| Yehpoh | city | | Indonesia | -8.4833333 | 115.5166667 | 436 | 63622 |
| Yehu | city | | Indonesia | 0.4333333 | 127.5833333 | 347 | 627 |
| Yeisowo | city | | Indonesia | 0.2666667 | 128.7833333 | 6 | 265 |
| Yem | city | | Indonesia | -7.7666667 | 140 | 3 | 378 |
| Yembekiri | city | | Indonesia | -1.85 | 134.15 | 3 | 416 |
| Yenburuo | city | | Indonesia | -0.9333333 | 134.8666667 | 3 | 2303 |
| Yende | city | | Indonesia | -2.3666667 | 134.5333333 | 203 | 228 |
| Yendidori | city | | Indonesia | -1.15 | 136.0166667 | 22 | 3840 |
| Yengah | city | | Indonesia | -6.5661111 | 107.8861111 | 344 | 102434 |
| Yenggarboi | city | | Indonesia | -0.6666667 | 135.6166667 | 0 | 3283 |
| Yenmanu | city | | Indonesia | -0.9333333 | 134.8166667 | 0 | 1299 |
| Yennanas Besir | city | Provinsi Papua | Indonesia | -0.4597222 | 130.6877778 | 0 | 268 |
| Yera | city | | Indonesia | -7.6166667 | 138.2333333 | 3 | 378 |
| Yetieprike | city | | Indonesia | -7.65 | 140.4 | 78 | 378 |
| Yetti | city | | Indonesia | -3 | 140.8833333 | 944 | 1195 |
| Yilapat | city | Propinsi Kalimantan Tengah | Indonesia | -3.2666667 | 114.55 | 3 | 7505 |
| Yiliyala | city | Propinsi Sulawesi Utara | Indonesia | 0.5569444 | 121.6188889 | 314 | 6157 |
| Yirimami | city | | Indonesia | -4.7666667 | 137.0166667 | 39 | 322 |
| Yoan | city | | Indonesia | -2.6666667 | 140.2333333 | 738 | 1198 |
| Yobi | city | Provinsi Papua | Indonesia | -1.7 | 136.45 | 3 | 87 |
| Yobi | city | | Indonesia | -1.7166667 | 138.0666667 | 32 | 1050 |
| Yodom | city | | Indonesia | -7.2666667 | 139.5333333 | 3 | 326 |
| Yogyakarta | city | Daerah Istimewa Yogyakarta | Indonesia | -7.8 | 110.3666667 | 439 | 602721 |
| Yohadian | city | | Indonesia | -1.95 | 132.0666667 | 3 | 1138 |
| Yomani | city | | Indonesia | -7.05 | 109.1166667 | 606 | 204670 |
| Yomber | city | | Indonesia | -2.1 | 134.3833333 | 3 | 304 |
| Yome | city | | Indonesia | -1.2 | 127.6166667 | 0 | 238 |
| Yomob | city | | Indonesia | -7.7666667 | 139.65 | 3 | 378 |
| Yomuka | city | | Indonesia | -7.4166667 | 138.6333333 | 13 | 366 |
| Yondoliu | city | | Indonesia | 0.2833333 | 128.7666667 | 465 | 265 |
| Yonggandur | city | | Indonesia | -8.5666667 | 140.8166667 | 85 | 378 |
| Yoppingar | city | | Indonesia | -2.4833333 | 134.5666667 | 465 | 484 |
| Yosonegoro | city | Propinsi Sulawesi Utara | Indonesia | 0.6333333 | 122.9230556 | 213 | 9649 |
| Yosowilangun | city | Propinsi Jawa Timur | Indonesia | -7.1486111 | 112.6163889 | 3 | 95153 |
| Yosowilangun | city | | Indonesia | -8.25 | 113.3 | 75 | 73726 |
| Yote | city | | Indonesia | -3 | 140.6166667 | 1863 | 1195 |
| Yubuwai | city | | Indonesia | -9.7833333 | 120.5166667 | 344 | 3170 |
| Yugi | city | | Indonesia | -7.6166667 | 139.45 | 3 | 378 |
| Yugil | city | | Indonesia | -7.6666667 | 139.5166667 | 3 | 378 |
| Yulbabuti | city | | Indonesia | -8 | 139.1833333 | 3 | 367 |
| Yuli | city | | Indonesia | -7.8 | 140.85 | 187 | 378 |
|
|