| Name | What | Region | Country | Lat | Long | Elev Ft. | Pop Est |
| Siakwalaya | city | Departamento de Gracias a Dios | Honduras | 15.0166667 | -83.65 | 19 | 420 |
| Siale | city | Departmento de Francisco Morazan | Honduras | 14.8666667 | -87.1833333 | 2358 | 3863 |
| Siale | city | Departamento de El Paraiso | Honduras | 14.3 | -86.2333333 | 2014 | 6104 |
| Siberia | city | Departamento de El Paraiso | Honduras | 14.25 | -86.2333333 | 2178 | 7186 |
| Sicacaira | city | Departamento de Olancho | Honduras | 14.7 | -85.0166667 | 505 | 822 |
| Sicaguara | city | Departmento de Francisco Morazan | Honduras | 14.3333333 | -87 | 3497 | 3594 |
| Sicaguara Abajo | city | Departmento de Francisco Morazan | Honduras | 14.6166667 | -87.1333333 | 2641 | 3683 |
| Sicaguara Arriba | city | Departmento de Francisco Morazan | Honduras | 14.6166667 | -87.1166667 | 2775 | 3663 |
| Sicalare | city | Departmento de Francisco Morazan | Honduras | 13.9166667 | -87.3 | 4491 | 8870 |
| Siciguara | city | Departmento de La Paz | Honduras | 14.0166667 | -88.0666667 | 5764 | 4778 |
| Sico | city | Departamento de Colon | Honduras | 15.8166667 | -85.1666667 | 1400 | 397 |
| Sicre | city | Departamento de Gracias a Dios | Honduras | 15.7833333 | -84.5833333 | 3 | 202 |
| Sicsayeri | city | Departamento de Olancho | Honduras | 14.7 | -85.0166667 | 505 | 822 |
| Sicsin Tiaica | city | Departamento de Gracias a Dios | Honduras | 14.7666667 | -84.95 | 390 | 561 |
| Siempre Viva | city | Departamento de Yoro | Honduras | 15.3166667 | -87.3 | 2532 | 3738 |
| Siempreviva | city | Departamento de Atlantida | Honduras | 15.5833333 | -87.25 | 1295 | 8901 |
| Sienpreviva | city | Departamento de Yoro | Honduras | 15.3166667 | -87.3 | 2532 | 3738 |
| Siete Cuchillas | city | Departamento de Copan | Honduras | 15.2333333 | -88.7666667 | 2621 | 12107 |
| Sigamane | city | Departmento de La Paz | Honduras | 14.1333333 | -87.9666667 | 5442 | 9437 |
| Siguanera | city | Departamento de Lempira | Honduras | 14.1333333 | -88.4666667 | 2965 | 6477 |
| Siguapa | city | Departmento de Francisco Morazan | Honduras | 14.9 | -87.25 | 1538 | 4982 |
| Siguapa | city | Departmento de Francisco Morazan | Honduras | 14.9666667 | -87.1666667 | 4570 | 4238 |
| Siguapate | city | Departamento de Choluteca | Honduras | 13.2186111 | -87.2975 | 22 | 12896 |
| Siguapate | city | Departamento de Choluteca | Honduras | 13.3666667 | -86.8666667 | 3461 | 5423 |
| Siguapate | city | Departamento de Olancho | Honduras | 15.05 | -86.6833333 | 2995 | 1410 |
| Siguara | city | Departmento de La Paz | Honduras | 14.0166667 | -88.0666667 | 5764 | 4778 |
| Siguara | city | Departamento de Yoro | Honduras | 15.3166667 | -86.9833333 | 2463 | 3091 |
| Siguatepeque | city | Departamento de Lempira | Honduras | 14.7 | -88.6333333 | 1889 | 22143 |
| Siguatepeque | city | Departamento de Comayagua | Honduras | 14.6 | -87.8333333 | 3500 | 16200 |
| Sikiapihni | city | Departamento de Gracias a Dios | Honduras | 14.9833333 | -85 | 308 | 564 |
| Silaca | city | Departamento de Olancho | Honduras | 15.0333333 | -86.8333333 | 2175 | 3336 |
| Silca | city | Departamento de Olancho | Honduras | 15.0333333 | -86.8333333 | 2175 | 3336 |
| Silca | city | Departamento de Olancho | Honduras | 14.8333333 | -86.5333333 | 2057 | 4103 |
| Sile | city | Departamento de Lempira | Honduras | 14.55 | -88.5166667 | 2985 | 6462 |
| Silimania | city | Departamento de Intibuca | Honduras | 14.2666667 | -88.1166667 | 4763 | 7871 |
| Silisgualagua | city | Departamento de El Paraiso | Honduras | 13.85 | -86.8833333 | 3720 | 5197 |
| Simarron | city | Departamento de Lempira | Honduras | 14.3166667 | -88.45 | 4396 | 4612 |
| Simbra | city | Departamento de Comayagua | Honduras | 14.7833333 | -87.8 | 2700 | 5043 |
| Similaton | city | Departmento de La Paz | Honduras | 14.05 | -88 | 6062 | 6481 |
| Similatón | city | Departmento de La Paz | Honduras | 14.05 | -88 | 6062 | 6481 |
| Simire | city | Departamento de El Paraiso | Honduras | 13.6 | -87 | 2329 | 7246 |
| Sinacar | city | Departamento de Ocotepeque | Honduras | 14.4333333 | -89.0333333 | 4744 | 7379 |
| Sinaloa | city | Departamento de Colon | Honduras | 15.7166667 | -85.9833333 | 131 | 4395 |
| Sinaloga | city | Departamento de Colon | Honduras | 15.7166667 | -85.9833333 | 131 | 4395 |
| Sincimara | city | Departamento de Lempira | Honduras | 14.4333333 | -88.5666667 | 4878 | 5141 |
| Sincimera | city | Departamento de Lempira | Honduras | 14.4333333 | -88.5666667 | 4878 | 5141 |
| Singore | city | Departmento de La Paz | Honduras | 14.0833333 | -87.9 | 4652 | 5355 |
| Siniguare | city | Departmento de Francisco Morazan | Honduras | 13.9666667 | -87.3 | 4619 | 27848 |
| Sinuapa | city | Departamento de Ocotepeque | Honduras | 14.45 | -89.1833333 | 2890 | 8006 |
| Sipul | city | Departamento de Gracias a Dios | Honduras | 15.0833333 | -84.9 | 403 | 363 |
| Siquiapisne | city | Departamento de Gracias a Dios | Honduras | 14.9833333 | -85 | 308 | 564 |
| Sirara | city | Departmento de La Paz | Honduras | 14.1666667 | -87.9666667 | 5134 | 10564 |
| Siria | city | Departmento de Francisco Morazan | Honduras | 14.65 | -87.15 | 2070 | 4009 |
| Siria 2 | city | Departmento de Francisco Morazan | Honduras | 14.65 | -87.15 | 2070 | 4009 |
| Siriboya | city | Departamento de Colon | Honduras | 15.9166667 | -85.2333333 | 0 | 47 |
| Sirin | city | Departamento de Lempira | Honduras | 14.7166667 | -88.4833333 | 4032 | 7197 |
| Sirinal | city | Departamento de Copan | Honduras | 15.0166667 | -88.7333333 | 2296 | 16858 |
| Sirsirtara | city | Departamento de Gracias a Dios | Honduras | 15.1333333 | -84.1166667 | 127 | 434 |
| Sirín | city | Departamento de Lempira | Honduras | 14.7166667 | -88.4833333 | 4032 | 7197 |
| Sisiba | city | Departamento de El Paraiso | Honduras | 13.5783333 | -87.0122222 | 3195 | 10971 |
| Sisiguara | city | Departmento de La Paz | Honduras | 14.0166667 | -88.0666667 | 5764 | 4778 |
| Sisimite | city | Departamento de Cortes | Honduras | 15.5833333 | -87.95 | 305 | 40923 |
| Sisique | city | Departamento de Yoro | Honduras | 15.1833333 | -86.95 | 5610 | 3384 |
| Sisire | city | Departamento de El Paraiso | Honduras | 13.65 | -86.95 | 2788 | 6627 |
| Sisirliteca | city | Departamento de Comayagua | Honduras | 14.6166667 | -87.8 | 4425 | 16200 |
| Sitio | city | Departamento de Intibuca | Honduras | 13.8333333 | -88.4 | 1315 | 13994 |
| Sitio | city | Departamento de Cortes | Honduras | 15.1333333 | -88.0833333 | 1102 | 12063 |
| Sitio | city | Departamento de Comayagua | Honduras | 14.4833333 | -87.6166667 | 2250 | 14158 |
| Sitio | city | Departamento de Atlantida | Honduras | 15.75 | -87.3 | 173 | 10215 |
| Sitio El Aguacate | city | Departmento de La Paz | Honduras | 14.0166667 | -88.1833333 | 3549 | 5751 |
| Sitio Grande | city | Departamento de Copan | Honduras | 14.95 | -88.9 | 3080 | 11179 |
| Sitio Quebrada Colorada | city | Departamento de Ocotepeque | Honduras | 14.7 | -89.0166667 | 4963 | 9417 |
| Sitio Viejo | city | Departamento de Santa Barbara | Honduras | 15.25 | -88.3833333 | 1771 | 8871 |
| Sitio de Mejia | city | Departamento de Atlantida | Honduras | 15.6833333 | -87.1666667 | 147 | 9944 |
| Sitio de Mejía | city | Departamento de Atlantida | Honduras | 15.6833333 | -87.1666667 | 147 | 9944 |
| Siuyu | city | Departamento de El Paraiso | Honduras | 13.7333333 | -86.8166667 | 2657 | 5277 |
| Siuyú | city | Departamento de El Paraiso | Honduras | 13.7333333 | -86.8166667 | 2657 | 5277 |
| Six Hut | city | Departamento de Islas de la Bahia | Honduras | 16.3666667 | -86.4166667 | 0 | 5027 |
| Six Huts | city | Departamento de Islas de la Bahia | Honduras | 16.3666667 | -86.4166667 | 0 | 5027 |
| Sixatara | city | Departamento de Gracias a Dios | Honduras | 15.6666667 | -84.8333333 | 242 | 345 |
| Sixayari | city | Departamento de Gracias a Dios | Honduras | 14.7666667 | -84.95 | 390 | 561 |